水稻在各个生育阶段因不良环境条件，或因栽培管理不当而引起种种生理障碍。在我区常见的主要有烂秧、发僵、早穗、早衰、翘稻头以及空、秕粒等，每年单晚发现生理障碍面积约８０００～１００００亩，不仅影响水稻正常生长，同时极度影响产量和品质。
烂秧发生于幼苗期，包括烂种、烂芽和死苗。烂种是指盲谷落田后，不发芽就腐烂，产生问题大多是稻谷丧失发芽力，即谷种不能发芽。烂芽是指芽谷落田后，未转青就死亡。产生问题大多是秧田水分控制不当，芽谷落田后深水淹灌，芽鞘徒长，根不入泥，头重脚轻，翻根倒芽，变成“跷脚”，这时芽谷生活力衰弱，易被病菌侵入，引起烂芽。死苗有黄枯和青枯两种，一般黄枯死苗常发生在２叶期，以缩脚秧苗较多，秧苗在低温下缓缓受害，引起体内新陈代谢活动紊乱，结果从老叶到嫩叶，逐渐变黄褐色枯死，叫做“剥皮死”。其秧苗基部多为病菌寄生而腐烂，因此拔秧时，根部容易脱离。青枯死苗多发生在３叶期，秧苗受低温影响，根系衰弱而受腐霉菌侵害，暴晴后未及时灌水，加剧秧苗生理失水而死亡。病苗从幼嫩的心叶部分开始卷缩萎蔫，呈污绿色，然后整株枯萎死亡，叫做“卷心死”。因当时苗基部尚未腐烂，手拉秧苗根部不会脱离。死苗多在２～３叶期发生的原因是此时处于“断奶期”秧苗抵抗力最弱。
防止烂秧，重点是掌握科学育秧技术。一是选用耐寒力抗病力强的良种，根据品种特性和不同前作，确定适宜的播种期、秧龄和播种量。二是提高种子催芽质量，做到“高温（３６～３８℃）露白，适湿（２５～３０℃）催芽，降温（１５～２０℃）薄摊练好芽”，把谷芽催得齐、匀、短、壮。三是提倡采用燥耕燥做水耥的通气秧田（半旱秧田），要求秧板软硬适中、播后塌谷加覆盖物。四是科学管水防止烂秧。提倡湿育，播种后灌秧沟水，保持秧板湿润，促使迅速竖芽扎根。从２～３叶期起可灌“薄皮水”以后逐渐加深并及时来更新水层。五是合理施肥，做到基肥稳，追肥早而轻，移栽前３～４天重施起身肥。
水稻发僵常发生在插秧后分蘖之前。病株因发根受阻，出叶和分蘖迟缓，叶片僵缩，致生长瘦弱，穗数减少，穗小粒少，影响产量。
在防止措施上，特别要注意施用腐熟的有机肥并防止用量过多引起中毒发僵。对已发僵的田块，应当立即排水轻搁，增加氧气，促使浮土沉实和有机肥的分解，消除毒害，并做到薄水勤灌勤露，脱水上水，有利稻苗扎根和起发。
水稻缺磷发僵，生长缓慢，新根少，根系细弱弹性小，病株簇立，叶片直笃叶色暗绿或灰绿色，鞘、叶长度比例失调，分蘖发生迟或不分蘖，远看稻苗暗中带紫灰色。防止缺磷发僵，关键是施好磷肥，如秧田基施过磷酸钙每亩４０公斤；插秧时施磷肥，每亩２５公斤。此外排水搁田，活跃根系，可增加磷的吸收量。
水稻发僵后，叶片上有赤色斑点，农民称铁锈稻。病株生长停顿，株型矮小，分蘖极少，叶色深绿，并出现大小不等的赤色斑点，最后全叶枯死。同时稻根老化新根少。由于稻根吸收能力变弱，钾的吸收量减少，生长处于停滞常态。
防止缺钾发僵，要坚持“以防为主防治结合”的原则。首先要防止耕耙过糊导致生理缺钾；二是实行水旱轮作，改善土壤的理化性状。三是发现缺钾发僵时，立即补施适量氯化钾或硫酸钾等钾肥。第三，做好水浆管理，及时轻搁薄水勤灌，多次落干，以改善土壤通气性，预防或减轻缺钾症的发生。
指水稻生育后期（抽穗至成熟），植株“未老先衰”。诊断时必须与病菌侵害所造成的“病理早衰”相区别。病株叶色最初呈橘黄色或棕色，以后逐渐枯黄，叶尖灰白枯死，叶薄而弯曲，远看一片枯焦。地下部根系生长衰弱，或发褐腐朽。早衰使秕粒增加，千粒重降低，影响产量。
引起早衰的原因很多，在栽培上，长期脱力和重搁，或因高肥高密，中期徒长郁蔽，均是导致早衰的重要原因。同时，早衰也与品种特性和不良天气特征情况的影响有关。一般矮杆品种的叶厚递增速度小，所以上位叶较薄，叶内水分易产生不平衡状态，导致失水而早衰枯叶。品种中凡通气组织比较发达和后期根系活力强的品种则不易早衰。在不良天气特征情况下，如热风、寒潮等均会促使叶片早衰。
防止早衰措施，主要选用后期根系活力强、上部叶片较厚、通气组织较发达的水稻良种。在管理上要加强中、后期肥水管理，看苗施好穗肥或壮粒肥，防止中期脱力，后期早衰；特别要做到“薄露灌溉”，多次轻搁，脱水上水防止根系早衰，达到养根保叶，促使根系活跃，秆青叶绿。
空壳是抽穗后开花未能受精所致。秕谷是受精后子房中途停止发育，或在灌浆过程中胚乳充实停止，或米粒未成熟而死亡，造成全秕、半饱和死米。空秕谷多少对产量影响很大。
造成空秕谷的根本原因，一是天气特征情况，包括温度、日照、降雨、风速等，其中以温度影响最大；水稻安全齐穗期的日平均温度粳稻需要２０℃以上，若遇到２０℃以下低温和３５℃以上高温均对受精不利，水稻灌浆期间的最适温度２１～２５℃。温度过低也不利谷粒灌浆结实。二是栽培条件，结实期稻株营养的东西的供应水平，对形成空、秕谷影响很大。结实期稻田排水不良或经常灌深水，土壤还原性增强，会引起黑根早衰，使空秕增加。结实后断水过早，削弱根系和功能叶的生活力，也会增加秕谷。
防止空、秕谷的反常发生，首先应选用结实良好、抗逆性和生活力强的品种。同时，在栽培上要抓住适期播种移栽，安全齐穗，防止出现早穗或迟穗；搞好肥水管理，防止中期封行过早，影响通风透光，后期植株贪青或早衰，造成营养失调。要使水稻从始至终保持根系活力和较多的功能叶，减少空秕率，提高千粒重，来提升单位面积产量。
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